News 
News
News
News
Feliu MAseras at the cover of the Dalton Transactions
Friday, 27 January 2012 13:09
Maseras' research group is featured in the cover of the Dalton Transactions themed issue 'Computational Chemistry of Molecular Inorganic Systems'.
The gladiators' fight at the amphitheatre in Tarragona represents the 'fight' between the two main mechanisms (concerted and SN2) to achieve the oxidative addition involved in many organometallic processes.
In the paper, they study the mechanisms of the oxidative addition in the reaction between bromomethane and Pd0phosphine complexes. They take into account several variables such as the number of ligands on the metal, the nature of the phosphine and the nature of the solvent.
If you want to find out more about the trends they have identified, why don´t you check out the paper?
Maria Besora, Christophe Gourlaouen, Brian Yates and Feliu Maseras
Dalton Trans., 2011, 40, 11089-11094
An XRQTC group got a Maratò project
Monday, 21 November 2011 09:15
The group
led by Prof. Jordi Villa, UPF-IMIM and member of the XRQTC participates in a
project funded by La Maratò de TV3,
dedicated to spinal cord and brain injuries.
The project
is entitled: Modulation of immune receptor activity: a new therapeutic strategy
for acute damage to the central nervous system "and has a funding of 395,684€.
The project
coordinator is Dr. Pérez-Simó Acarin Laia Subirana, Institut de Neurociències
de
The other
partners are:
- Dra.
- Dr.
- Dr. Hugo Peluffo Zavala, Instituto Pasteur de Montevideo,
XRQTC at Expoquimia
Tuesday, 15 November 2011 07:58
XRQTC will present its technologies at Expoquimia,at the Fundació Bosch i Gimpera stand (P6, 253) from 14th to 18th of november.
We will participate on 15th Tuesday at the round table "Las Científicas crean la química del futuro" with Lourdes Vega. Furthermore, we will have seminars at Pharma Process and Food Innovation:
Wadnesday 16th of november (Pharma Process):
- 15:30 Jumping into personalized medicine with the aScidea tools and services - Albert Mascarell aScidea-UPF
- 16:15 Computational drug design for cancer- Jaime Rubio, Universitat de Barcelona
Thursday 17th of november (Food Innovation):
- 15:30 Nutrigenomics and crop domestication made easy with aScidea tools and services - Albert Mascarell aScidea - UPF
Friday 18th of november (Pharma Process):
- 11:00 Drug metabolism from pharmaceutical prospects - Jean-Didier Maréchal, Universitat Autònoma de Barcelona.
Modesto Orozco receives an ERC Advanced Grant
Friday, 28 October 2011 11:32
Awarded by the European Research Council and providing funding of around 2 and 3 million Euros over five years, ERC Advanced Grants are given to a limited number of senior scientists.
The multidisciplinary project awarded within the category of Physical Sciences and Engineering is specialized in chemistry and computational biology, structural biology, biophysics, and bioinformatics and will have direct applications in several fields of biomedicine, such as the regulation of gene expression, and epigenetic mechanisms.
The research group is a member of the XRQTC.
Congratulations!
Desxifren el mecanisme de formació dels enllaços glicosídics
Thursday, 06 October 2011 13:06
Mitjançant tècniques de simulació molecular quàntica, investigadors del grup de recerca de Simulació Quàntica de Processos Biològics (SQPBIO) del laboratori Co.S.Mo.LAB, ubicat al Parc Científic Barcelona (PCB), han desxifrat el mecanisme de formació dels enllaços glicosídics en els enzims glicosiltransferases (GTs), responsables de l’estructura de molts hidrats de carboni. L’estudi es publica al darrer número d'Angewandte Chemie (doi:10.1002/anie.201104623) i està classificat com a VIP («Very Important Paper»).
El treball ha estat dirigit per Carme Rovira, professora d’Investigació ICREA al PCB i investigadora principal del grup de Simulació Quàntica de Processos Biològics i en ell ha col·laborat Albert Ardèvol, investigador predoctoral al mateix grup. Ambdós investigadors són també membres de l’Institut de Química Teòrica (IQTC) de la Universitat de Barcelona. Les simulacions han estat dutes a terme en el superordinador MareNostrum del Centre de Supercomputació de Barcelona (BSC).
L'estudi té importants implicacions en el camp de la glicobiologia, –l'àrea de la biologia que s'encarrega de l'estudi dels carbohidrats i llur influència en les funcions de les cèl·lules– tant pel que fa a l’obtenció eficient de noves estructures d’oligo i polisacàrids, com per a la recerca de nous agents terapèutics.
L'enllaç glicosídic és l'enllaç covalent que uneix dos monosacàrids a fi de formar els diferents hidrats de carboni com ara la cel·lulosa, el midó o el glucogen. La majoria dels enllaços glicosídics a la natura se sintetitzen a partir de sucres activats amb un cofactor (majoritàriament, un nucleòtid). Els enzims responsables d’aquesta acció són les glicosiltransferases, que formen l’enllaç glicosídic per transferència d’un anell de sucre des d’una molècula donadora (sucre activat) cap a una d’acceptora.
Aquests enzims poden actuar amb retenció o inversió de la configuració del carboni anomeric de l’enllaç glicosídic que formen. El mecanisme de les glicosiltransferases que actuen amb inversió és ben conegut, però el de les que actuen amb retenció va romandre un dels aspectes més enigmàtics al camp de la glicobiologia.
S’havia proposat que l’enzim participava activament en el mecanisme, a través de la formació d’un enllaç químic amb el sucre donador. Tanmateix, la manca d’evidència experimental clara va portar a pensar en un mecanisme del tipus “front-face” –extremadament inusual encara que amb precedents químics – on la reacció té lloc per una única “cara” del sucre. Aquest mecanisme ha estat envoltat d’una forta controvèrsia, ja que en principi implica que dos enllaços covalents s’estan formant i trencant, respectivament, en una mateixa regió de l’espai.
“El nostre estudi demostra, ara, que el mecanisme de tipus “front-face” és factible ja que té lloc mitjançant la formació d’una espècie amb càrrega positiva (un oxocarbocatió) de vida mitja extremadament curta que es desplaça ràpidament des del donador fins a l’acceptor. Contràriament al que es pensava, doncs, el mecanisme de tipus “front-face” no comporta la formació d’un estat de transició d’alta energia i, per tant, molt inestable” –afirma Carme Rovira.
L’enzim modelitzat és la glicosiltransferasa trehalosa-6-fosfat sintasa (OtsA), que participa en la síntesi final de la trehalosa, un disacàrid de gran importància en la natura però que no està present en mamífers, per la qual cosa l’OtsA esdevé una prometedora diana per a la recerca d’inhibidors bacterians i fungicides. Mitjançant tècniques de dinàmica molecular ab initio (basades en la química quàntica), Ardèvol i Rovira van aconseguir el mecanisme molecular complet de la reacció enzimàtica de formació de l’enllaç glicosídic, i demostrar que l’OtsA segueix un mecanisme del tipus “front-face”.
“Les glicosiltransferases són responsables de l’estructura de molts hidrats de carboni i, per tant, conèixer el seu mecanisme d’acció ajudarà a modificar la seva funcionalitat, incidint en l’obtenció més eficient d’hidrats de carboni ja coneguts i de noves estructures. Alhora, el coneixement del seu mecanisme molecular contribuirà al disseny d’inhibidors per a GTs implicats en malalties infeccioses” –afirma Carme Rovira.
More Articles...
Page 1 of 19
«StartPrev12345678910NextEnd»
