Xarxa de Referencia en Quimica Teorica i Computacional de Catalunya
Actualitat Notícies

noticies

Feliu Maseras a la portada de la revista Dalton Transactions

Divendres, 27 de Gener de 2012 13:09

Maseras' research group is featured in the cover of the Dalton Transactions themed issue 'Computational Chemistry of Molecular Inorganic Systems'.

The gladiators' fight at the amphitheatre in Tarragona represents the 'fight' between the two main mechanisms (concerted and SN2) to achieve the oxidative addition involved in many organometallic processes.
 
In the paper, they study the mechanisms of the oxidative addition in the reaction between bromomethane and Pd0phosphine complexes. They take into account several variables such as the number of ligands on the metal, the nature of the phosphine and the nature of the solvent.
If you want to find out more about the trends they have identified, why don´t you check out the paper?
 
Phosphine and solvent effects on oxidative addition of CH3Br to Pd(PR3) and Pd(PR3)2 complexes
Maria Besora, Christophe Gourlaouen, Brian Yates and Feliu Maseras
Dalton Trans., 2011, 40, 11089-11094
 
 
 

Un grup de la XRQTC a un projecte de la Maratò de TV3

Dilluns, 21 de Novembre de 2011 09:15

El grup liderat pel Prof. Jordi Villà, de la UPF-IMIM i membre de la XRQTC, participa en un projecte finançat per La Maratò de TV3, dedicat a lesions medul•lars i cerebrals adquirides.
El projecte porta per títol: "Modulació de l’activitat dels receptors immunitaris: nova estratègia terapèutica per al dany agut al sistema nerviós central" iamb un finançament de 395.684€.
La coordinadora del projecte és la Dra. Laia Acarin Pérez-Simó Subirana, de l’Institut de Neurociències de la Universitat Autònoma de Barcelona. La resta dels socis són:
  • Dra. Carme Solà Subirana, Institut d'Investigacions Biomèdiques de Barcelona
  • Dr. Juan Sayós Ortega, CIBBIM - Nanomedicina Hospital Universitari Vall d'Hebron
  • Dr. Hugo Peluffo Zavala, Instituto Pasteur de Montevideo, Uruguai

   

L'XRQTC a Expoquimia

Dimarts, 15 de Novembre de 2011 07:58

L'XRQTC presentarà la seva oferta tecnològica a Expoquimia, al mateix estand que la Fundació Bosch i Gimpera (P6, 253) del 14 al 18 de novembre.

Participarem el dimarts 15 a la taula rodona "Las Científicas crean la química del futuro" amb la Lourdes Vega. A més, tindrem quatre xerrades a Pharma Process i a Food Innovation:

Dimecres 16 de novembre (Pharma Process):

  • 15:30 Jumping into personalized medicine with the aScidea tools and services - Albert Mascarell aScidea-UPF
  • 16:15 Diseño computacional de fármacos contra el cáncer - Jaime Rubio, Universitat de Barcelona

Dijous 17 de novembre (Food Innovation):

  • 15:30 Nutrigenomics and crop domestication made easy with aScidea tools and services - Albert Mascarell aScidea - UPF

Divendres 18 de novembre (Pharma Process):

  • 11:00 Drug metabolism from pharmaceutical prospects - Jean-Didier Maréchal, Universitat Autònoma de Barcelona.
   

Modesto Orozco, obté un ERC Advanced Grant, l'ajut per projecte científic amb més prestigi d'Europea

Divendres, 28 de Octubre de 2011 11:32

El Consell Europeu de Recerca atorga els ERC Advanced Grant a un nombre molt reduït d’investigadors sènior amb un finançament que oscil·la entre els 2 i 3 milions d’euros per cinc anys.
 
El projecte multidisciplinar premiat dins la categoria de Ciències Físiques i Enginyeries s’ubica en les especialitats de química i biologia computacional, biologia estructural, biofísica i bioinformàtica i tindrà aplicacions directes en diverses àrees de la biomedicina com ara en la regulació d’expressió gènica i en els mecanismes epigenètics.
 
El grup dirigit per Modesto Orozco és un membre de la XRQTC.
 
Des d'aquí, li donem la enhorabona!
 
   

Desxifren el mecanisme de formació dels enllaços glicosídics

Dijous, 06 de Octubre de 2011 13:06

Mitjançant tècniques de simulació molecular quàntica, investigadors del grup de recerca de Simulació Quàntica de Processos Biològics (SQPBIO) del laboratori Co.S.Mo.LAB, ubicat al Parc Científic Barcelona (PCB), han desxifrat el mecanisme de formació dels enllaços glicosídics en els enzims glicosiltransferases (GTs), responsables de l’estructura de molts hidrats de carboni. L’estudi es publica al darrer número d'Angewandte Chemie (doi:10.1002/anie.201104623) i està classificat com a VIP («Very Important Paper»).
El treball ha estat dirigit per Carme Rovira, professora d’Investigació ICREA al PCB i investigadora principal del grup de Simulació Quàntica de Processos Biològics i en ell ha col·laborat Albert Ardèvol, investigador predoctoral al mateix grup. Ambdós investigadors són també membres de l’Institut de Química Teòrica (IQTC) de la Universitat de Barcelona. Les simulacions han estat dutes a terme en el superordinador MareNostrum del Centre de Supercomputació de Barcelona (BSC).
L'estudi té importants implicacions en el camp de la glicobiologia, –l'àrea de la biologia que s'encarrega de l'estudi dels carbohidrats i llur influència en les funcions de les cèl·lules– tant pel que fa a l’obtenció eficient de noves estructures d’oligo i polisacàrids, com per a la recerca de nous agents terapèutics.

L'enllaç glicosídic és l'enllaç covalent que uneix dos monosacàrids a fi de formar els diferents hidrats de carboni com ara la cel·lulosa, el midó o el glucogen. La majoria dels enllaços glicosídics a la natura se sintetitzen a partir de sucres activats amb un cofactor (majoritàriament, un nucleòtid). Els enzims responsables d’aquesta acció són les glicosiltransferases, que formen l’enllaç glicosídic per transferència d’un anell de sucre des d’una molècula donadora (sucre activat) cap a una d’acceptora.

Aquests enzims poden actuar amb retenció o inversió de la configuració del carboni anomeric de l’enllaç glicosídic que formen. El mecanisme de les glicosiltransferases que actuen amb inversió és ben conegut, però el de les que actuen amb retenció va romandre un dels aspectes més enigmàtics al camp de la glicobiologia.

S’havia proposat que l’enzim participava activament en el mecanisme, a través de la formació d’un enllaç químic amb el sucre donador. Tanmateix, la manca d’evidència experimental clara va portar a pensar en un mecanisme del tipus “front-face” –extremadament inusual encara que amb precedents químics – on la reacció té lloc per una única “cara” del sucre. Aquest mecanisme ha estat envoltat d’una forta controvèrsia, ja que en principi implica que dos enllaços covalents s’estan formant i trencant, respectivament, en una mateixa regió de l’espai.

“El nostre estudi demostra, ara, que el mecanisme de tipus “front-face” és factible ja que té lloc mitjançant la formació d’una espècie amb càrrega positiva (un oxocarbocatió) de vida mitja extremadament curta que es desplaça ràpidament des del donador fins a l’acceptor. Contràriament al que es pensava, doncs, el mecanisme de tipus “front-face” no comporta la formació d’un estat de transició d’alta energia i, per tant, molt inestable” –afirma Carme Rovira.

L’enzim modelitzat és la glicosiltransferasa trehalosa-6-fosfat sintasa (OtsA), que participa en la síntesi final de la trehalosa, un disacàrid de gran importància en la natura però que no està present en mamífers, per la qual cosa l’OtsA esdevé una prometedora diana per a la recerca d’inhibidors bacterians i fungicides. Mitjançant tècniques de dinàmica molecular ab initio (basades en la química quàntica), Ardèvol i Rovira van aconseguir el mecanisme molecular complet de la reacció enzimàtica de formació de l’enllaç glicosídic, i demostrar que l’OtsA segueix un mecanisme del tipus “front-face”.

“Les glicosiltransferases són responsables de l’estructura de molts hidrats de carboni i, per tant, conèixer el seu mecanisme d’acció ajudarà a modificar la seva funcionalitat, incidint en l’obtenció més eficient d’hidrats de carboni ja coneguts i de noves estructures. Alhora, el coneixement del seu mecanisme molecular contribuirà al disseny d’inhibidors per a GTs implicats en malalties infeccioses” –afirma Carme Rovira.

   

Pàgina 1 de 19

«IniciaAnterior12345678910SegüentFinal»

Activitats XRQTC

Febrer 2012
Dil Dim Dim Dij Div Dis Diu
1 2 3 4 5
6 7 8 9 10 11 12
13 14 15 16 17 18 19
20 21 22 23 24 25 26
27 28 29